Spanscriptomics: Análisis de células únicas usando Galaxy
Los días 29 y 30 de noviembre de 2021 organizaremos un taller global sobre el análisis de datos Single Cell (o de Célula Única) utilizando tutoriales de la Red de Formación de Galaxy (o GTN por sus siglas en inglés: Galaxy Training Network). Este será un evento en línea que abarcará todas las zonas horarias. Todas las sesiones de entrenamiento están pregrabadas, por lo que puedes trabajar en ellas a tu propio ritmo administrando tu tiempo como más te convenga.
¿Qué es el análisis de datos de Single Cell? Aquí nos enfocamos específicamente en la secuenciación de ARN, donde se identifican todas (¡o un subconjunto!) de los transcritos generados por una sola célula. Aunque computacionalmente es complicado, bióinstitutions de todo el mundo! están utilizando esta potente técnica para identificar tipos de células en diferentes organismos y su asociación con enfermedades, envejecimiento y más.
Habrá un equipo capacitado y experto durante el curso dedicado a guiarte, responder tus preguntas y asegurarse de que aprendas no solo a tu propio ritmo sino que al finalizar hayas adquirido las habilidades objetivo de este taller. Si estás atorado, confundido o requieres una asesoría ¡Entra en contacto en Slack! ¡Estaremos encantados de ayudarte y saber de ti durante el curso!
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Información práctica
Cuándo: del 29 al 30 de noviembre de 2021 (todas las zonas horarias)
Quién: Hablantes nativos de español
Precio: Gratis
Formato: Virtual y asíncrono. Todas las sesiones de capacitación están pregrabadas, puedes trabajar en ellas a tu propio ritmo, con instructores disponibles en línea que te asistirán los 2 días.
Contacto: Stefana Dreptate, Wendi Bacon
Organizado por: The Open University, The Galaxy Training Network (GTN) Project.
Program
| Actividad | Recursos | Duración | Autor/a original | |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Introducción a Galaxy | Lección, Diapositivas & Video | 30 min | Saskia Hiltemann, Helena Rasche, Nicola Soranzo |
| 2 | Breve introducción a Galaxy | Tutorial y Video guiado | 30 min | Anna Syme |
| 3 | Introducción al análisis de RNA-seq de células únicas | Lección, Diapositivas & Video | 30 min | Mehmet Tekman |
| 4 | Generación de una matriz de datos de RNA-seq de células únicas utilizando Alevin | Tutorial y Video guiado | 3 h | Wendi Bacon, Jonathan Manning |
| 5 | Filtrado, representación y exploración de datos de RNA-seq de células únicas | Tutorial y Video guiado | 3h | Wendi Bacon |
Spanscriptomics: “¿Por qué?”
Este taller está dirigido a hablantes nativos de español de todo el mundo. El Galaxy Training Ñetwork de bioinformática con personas nativas de habla hispana ha desarrollado materiales traducidos al español. Este taller forma parte de un estudio más amplio sobre el impacto! de la traducción de materiales del inglés al español. Durante el taller, estarán disponibles todos los materiales en tres versiones distintas: originales en inglés, traducidos al español automáticamente o traducidos al español por humanos. Al inicio, el tipo de material con el que arrancarás los tutoriales será asignado aleatoriamente, pero podrás cambiar entre versiones en cualquier momento que lo desees. La encuesta de idiomas dentro de este taller forma parte de un proyecto más amplio sobre la descolonización de la educación científica, que puede conducir a la traducción a gran escala de materiales educativos, tanto de otros idiomas al Inglés como del Inglés a otros idiomas. Agradecemos tu participación en este estudio.
Como parte del estudio de investigación, te enviaremos al final del taller, una encuesta que tomará de cinco a diez minutos e incluirá una pregunta sobre si hiciste uso del material en distintas versiones al que te fue asignado al inicio.
Agradecimientos
Este taller sólo ha sido posible gracias a nuestro fabuloso equipo y sus instituciones colaboradoras. ¡Agradecemos por la donación de The Company of Biologists!
Presentadores, instructoras/es, facilitadoras/es, organizadoras/es y resto del personal
Instituciones
